Le système de gestion de la qualité de NetApp est certifié ISO 9001:2008. Le périmètre de la certification de NetApp est la conception et la fabrication de systèmes hautes performances de stockage de données en réseau.

Les systèmes de gestion de NetApp sont inscrits au registre de certification ISO 9001 depuis mai 1997. Le 15 septembre 2014, NetApp a obtenu la certification ISO 9001:2008.