O Sistema de Gestão de Qualidade da NetApp é certificado para o ISO 9001:2008. O escopo da certificação da NetApp é o Design e Manufatura de Dispositivos de Storage de Rede de Alto Desempenho (Design and Manufacture of High Performance Network Data Storage Devices).

Os sistemas de gerenciamento da NetApp estão registrados com a certificação ISO 9001 desde maio de 1997. Mais recentemente, em 15 de setembro de 2014, a NetApp recebeu o certificado de registro para ISO 9001:2008.